Эта игра открывает новую трилогию, где мы играем за Лиру (дочь главной героини первых трех игр), которая оказалась заперта в измерении, похожем на ее собственное, и должна использовать летающее устройство своего отца, чтобы найти Часовщика и вернуться домой.